Повышение эффективности применения боевой авиации по кораблям за счет увеличения возможностей управляемого ракетного оружия привело руководство ВМФ СССР в 1980-х годах к мысли о необходимости повышения возможностей морских средств ПВО малой дальности. Особенно актуальной была задача усиления зенитной защиты катеров и кораблей небольшого водоизмещения, которые, в силу массогабаритных ограничений невозможно было оснащать имеющимися мощными зенитными ракетными комплексами. Одним из образцов таких комплексов стала турельная установка ЗМ47-01Э «Комар» с ЗУР типа «Игла» и «Игла-С», разработанная специалистами компании РАТЕП (входит в состав АО «Концерн ВКО «Алмаз-Антей»). Впервые она была продемонстрирована на Международном военно-морском салоне в Санкт-Петербурге в 2005 г.

В дальнейшем в АО «РАТЕП» приняли решение придать ЗМ47-01Э «Комар» новое качество, превращающее его в уникальный образец высокоточного оружия. Главное отличие новой модификации заключается в том, что комплекс 3М47-03Э «Комар» (он же "Гибка-М3") предусматривает введение в состав боевых средств, кроме зенитных ракет типа «Игла-С», управляемых ракет 9М120-1 «Атака» с различными типами боевых частей. Тем самым без оснащения кораблей дополнительными пусковыми установками существенно расширяются их боевые возможности при проведении морских и десантных или противодесантных операций. В такой конфигурации 3М47-03Э «Комар» позволяет защищать надводные корабли в зоне сверхмалой дальности от атак противокорабельных ракет, самолетов и вертолетов в условиях естественных (фоновых) и искусственных помех (выполнять функции противовоздушной обороны), а также поражать надводные (функции противокатерной обороны) и береговые средств нападения противника.

И главное, обновленная установка может размещаться и на суше. В наземном варианте 3М47-03Э «Комар» обеспечивает оборону важнейших береговых малоразмерных, точечных объектов и периметра протяженных (установкой нескольких комплексов) объектов, прикрытие средств ПВО от ударов тактической авиации и БЛА в условиях радиоэлектронного и огневого противодействия. Применяемые управляемые ракеты (УР) «Атака» могут иметь кумулятивную тандемную боевую часть, фугасную боевую часть с объемнодетонирующим составом и осколочно-фугасную боевую часть.

Таким образом, комплекс 3М47-03Э «Комар» предназначен для защиты надводных кораблей и судов водоизмещением от 50 тонн и выше в зоне сверхмалой дальности от атак противокорабельных ракет, средств воздушного нападения противника в условиях естественных и искусственных помех, а также для нанесения ударов по морским и наземным целям. Комплекс обеспечивает наведение и дистанционный автоматизированный пуск ракет типа «Игла-С» и «Атака» с гиростабилизированной пусковой установки. Отличительные особенности 3М47-03Э «Комар» при использовании ракет типа «Игла-С» - реализация принципа «выстрелил-забыл», полная автоматизация боевых процессов, высокая помехозащищенность, возможность вести огонь автономно - при выходе из строя внешних сенсоров.

Зона поражения ЗУР типа «Игла-С» составляет от 5 метров до 3,5 км по высоте и от 500 м до 6 км по дальности. Имеется возможность поражения целей, летящих со скоростью до 400 м/с. Пассивная оптическая следящая головка самонаведения с селектором искусственных тепловых помех обеспечивает принцип ведения огня «выстрелил-забыл». Стандартное количество ракет на модуле универсальном пусковом - две «Игла-С». Одновременно комплекс обстреливает только одну цель. УПН сопряжена с автоматизированным рабочим местом оператора (АРМ). На АРМ принимается целеуказание с общекорабельных информационных систем, таких как РЛС «Фуркэ», «Фрегат», «Позитив». Допоиск, захват и автосопровождение целей, а также автономная работа комплекса реализуются за счет оптико-электронной системы (ОЭС), размещенной на УПН. ОЭС имеет телевизионные и тепловизионный каналы. Максимальная дальность обнаружения самолетов тактической авиации с помощью телекамеры составляет 20 км, для телевизионного канала – 12 км, дальность автосопровождения – 12 и 8 км соответственно. Одновременно обеспечивается обстрел одной воздушной цели ракетой «Игла-С», хотя при этом «Атакой» может обстреливаться другая цель. Еще один вариант обстрела воздушной цели – залп двумя ракетами с разных пусковых модулей. УПН обеспечивает наведение пусковых модулей в направлении на цель по угловым координатам по командам с АРМ.

При этом можно обстреливать «Атакой» вторую цель, если первая поражается «Иглой-С». Ракеты комплекса «Атака» имеют три модификации с разными типами боевых частей: тандемной кумулятивной, фугасной с объемно-детонирующим составом, осколочно-фугасной. Все они могут входить в состав комплекса «Комар». Таким образом обеспечивается поражение основных боевых танков и других боевых машин с тяжелым бронированием, легкой бронетехники и  небронированных машин, малотоннажных кораблей и катеров, фортификационных сооружений (ДОТ, ДЗОТ), живой силы противника как на открытой местности, так и в укрытиях. Также «Атакой» можно стрелять и по воздушным целям: самолетам, вертолетам, беспилотникам и управляемым авиабомбам. Границы зоны поражения при ведении огня УР «Атака» по дальности составляют от одного до шести километров, по высоте – до двух километров. Максимальная скорость воздушной цели – 150 м/с, морской – 50 узлов. Максимальная высота поражения воздушной цели в диапазоне дальности – 3,3 км.

Комплекс 3М47-03Э «Комар» состоит из двух основных элементов: автоматизированного рабочего места оператора (АРМ) и установки пусковой наводимой (УПН). В состав УПН входит опорно-поворотное устройство, комплект аппаратуры управления и пусковых модулей, пусковая установка, оптико-электронная система (ОЭС), а также в комплекс входит прибор электропитания (ПЭ) и ЗИП. Дополнительно может поставляться прибор сопряжения и коммутации, обеспечивающий сопряжение по цифровым и аналоговым каналам связи с артиллерийскими установками и другими системами корабля. В базовом варианте комплекс ЗМ47-01Э «Комар» является простым и эффективным средством ПВО сверхмалой дальности. Модификация 3М47-03Э «Комар», обеспечивающая размещение УР «Атака», значительно повышает его возможности, позволяя боевым катерам и кораблям постоять за себя при встрече с разными по водоизмещению, или даже более крупным противником, а также дает возможность атаковать наземные объекты. Применение ракет «Игла-С» и «Атака» по воздушным целям позволяет максимально использовать противовоздушный потенциал комплекса, а в умелых руках «Игла-С» может применяться и по надводным целям, что делает комплекс 3М47-03Э «Комар» уникальным.